O El Niñu se tu teď stále relativně dost mluví. Ví se už, že tento jev se poprvé objevil asi před 5000 lety (ví se to třeba na základě zkoumání vrstev usazenin v oblastech postižených v době El Niña záplavami apod.). Je zajímavé, že ve stejné době se začínají ve středním Peru stavět velké chrámy. Zpočátku se El Niño konalo jen zřídka, asi tak jednou za 30 let. Někdy před 3000 lety se začalo objevovat mnohem častěji, asi tak každé tři až pět let, stejně jako dnes. V té době stavby chrámů v Peru ustaly. Takže přirozené, že se lidé ptají, zda-li oba jevy nějak souvisí. Objevila se teorie, podle níž při počátečních dlouhých intervalech mezi následujícími El Niñi mohli tehdejší kněži snadno vzbudit dojem, že svými kouzly se jim podařilo El Niño nadlouho úspěšně zahnat. Lídé se pak s vděčnosti dosti ochotně účastnili stavby jejich chrámů. Když se frekvence El Niñ před 3000 lety podstatně zvětšila, lidé si uvědomili, že kněží nejsou k ničemu a už nebyli ochotni je jakkoliv podporovat.